Det stiller kirken over for mange og store udfordringer: De mange nyomvendte skal have oplæring i den kristne tro, og der skal f.eks. uddannes flere præster, evangelister og ledere og bygges mange nye kirker. Dertil kommer kirkens store engagement i bl.a. skoleundervisning og uddannelse, sundhedsvæsen, nødhjælps- og udviklingsarbejde.

Kirken har efterhånden selv mange velkvalificerede medarbejdere, men har fortsat brug for hjælp fra bl.a. Dansk Ethioper Mission til at løse disse og mange andre opgaver. Læs artiklen: Opgaverne er mange.

Se billedserier om kirkens arbejde i Etiopien og Mekane Yesus kirkens hjemmeside.

Lasse Lindegaard Iversens bacheloropgave: "Den karismatiske bevægelse i Ethiopian Evangelical Church Mekane Yesus og dennes betydning for kirkens lutherske identitet".

Sprogstrid førte til kirkesplittelse

Flere års sprogstrid internt i Mekane Yesus kirken førte i marts 2001 til at nogle menigheder og enkeltpersoner i og omkring Addis Ababa brød ud og dannede en ny kirke: Addis Ababa og omegns evangeliske kirke Mekane Yesus (AASECMY).

I august 2008 førte et af utallige mæglingsforsøg til forsoning mellem de to kirker som blev genforenet til én Mekane Yesus Kirke ved en gudstjeneste den 27. august. Læs mere.

Dansk Ethioper Mission sendte de første missionærer til Etiopien i 1948, og i de første mange år var DEMs arbejde koncentreret om Bale provinsen i Sydetiopien (med udgangspunkt i Dodola).

Siden Mekane Yesus kirken blev dannet i 1959, har den været DEMs naturlige samarbejdspartner i Etiopien, og DEM har støttet kirken med økonomiske tilskud og udsendte medarbejdere igennem alle årene. (Dog var det ikke muligt at sende medarbejdere til Etiopien i 1977-1980 efter den marxistiske magtovertagelse i slutningen af 1970-erne.)

I dag arbejder DEM især sammen med to synoder i Sydetiopien: South Central Ethiopia Synod med hovedkontor i Hawassa og Wabe Batu Synod med hovedkontor i Dodola.